La communauté juive établie à Besançon au XIVe siècle quitta la ville au XVe et se reforme pendant la Révolution. Au début du XIXe elle aménage une synagogue au 19 rue de la Madeleine. En 1869, on inaugure la nouvelle synagogue, oeuvre de l’architecte Pierre Marnotte, sur le quai de Strasbourg. Le banquier Adolphe Veil-Picard offre la grille qui entoure le jardin devant ce sanctuaire. Pierre Marnotte a opté pour une architecture volontairement orientaliste aussi bien à l’intérieur qu’à l’extérieur.
Répertorié aux Monuments Historiques en 1984.